Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf280dQ68FE8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf280dQ68FE8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms