Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3ipQ68EF0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab3ipQ68EF0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms