Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nlrp4fQ66X05 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp4fQ66X05 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms