Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Top2bQ64511 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Top2bQ64511 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Top2bQ64511 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms