Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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PtprjQ64455 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PtprjQ64455 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprjQ64455 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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PtprjQ64455 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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PtprjQ64455 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PtprjQ64455 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PtprjQ64455 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PtprjQ64455 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprjQ64455 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprjQ64455 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprjQ64455 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprjQ64455 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprjQ64455 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprjQ64455 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprjQ64455 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprjQ64455 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprjQ64455 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprjQ64455 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprjQ64455 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprjQ64455 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprjQ64455 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprjQ64455 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprjQ64455 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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