Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm4sf1Q64302 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm4sf1Q64302 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm4sf1Q64302 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms