Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col4a5Q63ZW6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a5Q63ZW6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col4a5Q63ZW6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms