Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vat1Q62465 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vat1Q62465 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms