Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sp4Q62445 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp4Q62445 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms