Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Kdm5dQ62240 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Kdm5dQ62240 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Kdm5dQ62240 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Kdm5dQ62240 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms