Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm38Q62176 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbm38Q62176 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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