Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrn1Q61809 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn1Q61809 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms