Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna11Q61716 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna11Q61716 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms