Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pafah1b2Q61206 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pafah1b2Q61206 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pafah1b2Q61206 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pafah1b2Q61206 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pafah1b2Q61206 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pafah1b2Q61206 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pafah1b2Q61206 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms