Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Tsg101Q61187 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Tsg101Q61187 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Tsg101Q61187 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsg101Q61187 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Tsg101Q61187 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsg101Q61187 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsg101Q61187 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms