Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna1Q60960 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna1Q60960 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms