Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Neurod1Q60867 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Neurod1Q60867 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Neurod1Q60867 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Neurod1Q60867 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Neurod1Q60867 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Neurod1Q60867 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Neurod1Q60867 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Neurod1Q60867 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Neurod1Q60867 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Neurod1Q60867 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Neurod1Q60867 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Neurod1Q60867 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Neurod1Q60867 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms