Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn2dQ60773 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms