Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmelQ60696 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms