Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2f1Q60632 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2f1Q60632 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2f1Q60632 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms