Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5bQ60519 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms