Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A1cfQ5YD48 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A1cfQ5YD48 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1cfQ5YD48 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms