Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV7

Setd5, SET domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd5Q5XJV7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Setd5Q5XJV7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Setd5Q5XJV7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Setd5Q5XJV7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms