Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd5Q5VCS6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms