Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdcp1Q5U462 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdcp1Q5U462 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdcp1Q5U462 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms