Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13Q5SWW4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13Q5SWW4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms