Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r195Q5SVD6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r195Q5SVD6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms