Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r196Q5SVD5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms