Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc42Q5SV66 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc42Q5SV66 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc42Q5SV66 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms