Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd40Q5SUE8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd40Q5SUE8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.1 ms