Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Utp18Q5SSI6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp18Q5SSI6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Utp18Q5SSI6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms