Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps54Q5SPW0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps54Q5SPW0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps54Q5SPW0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps54Q5SPW0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps54Q5SPW0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps54Q5SPW0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps54Q5SPW0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps54Q5SPW0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps54Q5SPW0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps54Q5SPW0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps54Q5SPW0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms