Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d4Q5RJF7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d4Q5RJF7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna2d4Q5RJF7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms