Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam208bQ5DTT3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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