Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc27a5Q4LDG0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc27a5Q4LDG0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms