Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc1cQ4KL78 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Khdc1cQ4KL78 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms