Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Shank3Q4ACU6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shank3Q4ACU6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms