Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt35Q497I4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.7 ms