Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms