Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd5Q3V1H9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms