Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms