Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk4Q3V129 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk4Q3V129 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 362.1 ms