Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc110Q3V125 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc110Q3V125 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms