Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dnah12Q3V0Q1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnah12Q3V0Q1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnah12Q3V0Q1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms