Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Garnl3Q3V0G7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms