Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms