Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms