Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5aQ3UXZ9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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