Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clpsl2Q3UW21 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clpsl2Q3UW21 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms