Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nr1d1Q3UV55 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr1d1Q3UV55 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr1d1Q3UV55 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr1d1Q3UV55 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr1d1Q3UV55 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr1d1Q3UV55 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr1d1Q3UV55 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr1d1Q3UV55 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr1d1Q3UV55 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nr1d1Q3UV55 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nr1d1Q3UV55 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms